امريفلوكان يستخدم لعلاج التهاب المهبل الفطري الناتج عن داء المبيضات حيث يعمل على القضاء على الفطريات المسببه للعدوى وتخفيف الاعراض المزعجه مثل الحكه والافرازات كما يستخدم في علاج داء المبيضات الجهازي الذي يصيب الفم والبلعوم والمريء والتهابات المسالك البوليه ويساهم في تحسين الحاله الصحيه والحد من تكرار العدوى.
يساعد الدواء في علاج بعض الحالات الفطريه الخطيره مثل الالتهاب الرئوي والتهاب السحايا كما يستخدم امريفلوكان في الوقايه من العدوى الفطريه لدى مرضى زرع نخاع العظم ومرضى السرطان الذين يتلقون العلاج الكيماوي او الاشعاعي حيث يعمل على دعم المناعه وتقليل خطر الاصابه بالعدوى الفطريه والحفاظ على استقرار الحاله الصحيه بشكل امن وفعال.