مضادة للفطريات واسعة الطيف يمتص بصورة جيدة ويمر بسهولة عبر الحاجز الدموي والدماغي للسائل الدماغي الشوكي. فلوكونازول يثبط تصنيع إرغوستيرول و هذا يتلف الغشاء الخلوي الفطري و يثبط بناء الغشاء الخلوي للفطريات.