دواء فونجيكان يستخدم بشكل اساسي لعلاج الالتهابات الفطرية التي تصيب الجسم ويعتبر فعالا في معالجة مجموعة متنوعة من العدوى التي تسببها الفطريات بما في ذلك تلك التي تؤثر على الجلد، الاظافر، والأغشية المخاطية، يمكن ان يوصف هذا الدواء لعلاج داء المبيضات الفموي وهي عدوى فطرية في الفم، الالتهابات الفطرية المهبلية، والعدوى الفطرية التي تؤثر على مناطق أخرى من الجسم، يستخدم
فونجيكان ايضا في حالات الالتهابات الفطرية الأكثر تعقيدا أو المزمنة بنصيحة طبية لتحديد الجرعة المناسبة حسب نوع العدوى وشدة الحالة ومن الضروري اتباع تعليمات الطبيب بدقة أثناء استخدام هذا الدواء لتجنب أي اثار جانبية أو مشكلات محتملة.