يعتبر سيبروفلوكساسين اميريا فعالا في التعامل مع العدوى الناتجة عن انواع معينة من البكتيريا، ويشمل ذلك التهابات الجهاز التنفسي، مثل التهاب الشعب الهوائية الحاد وبعض حالات الالتهاب الرئوي، كما يستخدم سيبروفلوكساسين اميريا لعلاج التهابات المسالك البولية، بما في ذلك التهابات المثانة والكلى، يوصف
سيبروفلوكساسين لعلاج التهابات الجلد والأنسجة الرخوة والعدوى الناتجة عن الجروح، يستخدم الدواء أيضا لعلاج العدوى المعوية الناجمة عن أنواع معينة من البكتيريا كما قد ينصح باستخدامه في حالات العدوى المنتقلة جنسيا.