دواء سبورانوكس يستخدم بشكل شائع لعلاج مجموعة متنوعة من الالتهابات الفطرية التي قد تؤثر على مناطق مختلفة من الجسم ويتم وصفه لعلاج التهابات الأظافر الفطرية التي تظهر عادة كتغير في لون أو شكل الاظافر، معالجة حالات مرضية مثل عدوى الجلد الفطرية، عدوى المهبل الناتجة عن الفطريات، والالتهابات الفطرية التي تصيب الفم والحلق،
سبورانوكس يستخدم أيضا في علاج حالات أكثر تعقيدا مثل العدوى الفطرية الجهازية التي قد تؤثر على الأعضاء الداخلية وخاصة عند المرضى الذين يعانون من ضعف جهاز المناعة، كما يمكن أن يوصف في بعض الأحيان للوقاية من الالتهابات الفطرية لدى الأشخاص الأكثر عرضة للاصابة بها نتيجة تلقيهم لعلاجات كيميائية أو خضوعهم لزراعة الأعضاء.