يستعمل دواء فلوموكس لعلاج امراض الجهاز التنفسي مثل التهاب الشعب الهوائية والتهاب الرئة، التهابات في منطقة الأنف والأذن والحلق، اضطرابات الجهاز الهضمي بما في ذلك التهاب الأمعاء والتهاب المرارة وحمى التيفوئيد، التهابات في الجهاز البولي والتناسلي مثل التهاب الكلى والتهاب البروستاتا وداء السيلان، ويعالج
فلوموكس التهابات الجلد والأنسجة تحت الجلد مثل الخراجات والتهاب النسيج الخلوي والتهابات ما بعد العمليات الجراحية، التهاب العظام ونخاع العظم، حالات أخرى مثل تجرثم الدم والتهاب بطانة القلب.