يستعمل دواء فلوكاموكس فى علاج التهابات القصبات الهوائية الحادة والمزمنة، التهابات الحوض، الالتهاب الرئوي، التهابات الجهاز البولي، التهابات الأذن والأنف والحنجرة، التهابات الجلد والأنسجة تحت الجلد، ويعالج
فلوكاموكس ايضا التهابات الجهاز التناسلي الأنثوي، يتمتع الأموكسيسيلين والفلوكلوكساسيلين بتأثير تآزري ضد الميكروبات الحساسة حيث تبقى الكائنات الدقيقة التي تستجيب لأي من المادتين الفعالتين قابلة للعلاج عند استخدامهما معا مما يدل على عدم وجود تفاعل مضاد بينهما.