فلوكستين يستخدم لعلاج الوسواس القهري حيث يساعد على تقليل الافكار الوسواسية والسلوكيات المتكررة ويعمل على تحسين القدرة على التحكم في الانفعالات والمشاعركما يستخدم في علاج اضطراب الهلع واضطرابات الاكل مثل الشره المرضي واضطراب ما قبل الحيض مما يساهم في تحسين نوعية الحياة وتقليل القلق والتوتر المرتبط بهذه الحالات.
يساهم فلوكستين في علاج الاكتئاب كما يستخدم كعلاج مساعد في حالات الاكتئاب الثنائي القطب كما يساعد على تحسين المزاج وتقليل الشعور بالحزن وفقدان الرغبة في الانشطة اليومية ويعزز القدرة على التركيز والتفاعل الاجتماعي عند الالتزام بالدواء والمتابعة الدورية مع الطبيب المعالج.