يستخدم دواء بيبزول لعلاج القرحة الهضمية في المعدة والاثني عشر وارتجاع المريء والآفات التآكلية والتقرحية في المعدة والاثني عشر المرتبطة باستخدام مضادات الالتهاب غير الستيروئيدية ويعالج ايضا دواء
بيبزول قرحة الإجهاد وهي آفات تآكلية وتقرحية في المعدة والاثني عشر مرتبطة ببكتيريا هيليكوباكتر بيلوري كجزء من العلاج المعقد ويغالج ايضا
بيبزول متلازمة زولينجر إليسون.