موتاميسين حقن لمعالجة السرطان ويستخدم لعلاج بعض الاورام الخبيثة مثل سرطان المعدة وسرطان القولون وسرطان البنكرياس حيث يعمل على تدمير الخلايا السرطانية من خلال التأثير على الحمض النووي ومنع انقسام الخلايا وانتشارها في الجسم ويعطى هذا الدواء عن طريق الحقن الوريدي تحت اشراف طبيب مختص مع ضرورة المتابعة المستمرة لوظائف الكلى والكبد والدم لتفادي المضاعفات التي قد تشمل نقص خلايا الدم او التهابات بالفم او اضطرابات تنفسية كما ينصح بتجنب التعرض للعدوى اثناء فترة العلاج بسبب ضعف المناعة ويعتبر
موتاميسين من الادوية الفعالة التي تستخدم ضمن بروتوكولات العلاج الكيميائي للحد من نمو وانتشار الخلايا السرطانية.