يستخدم دواء هيبارين في العديد من الحالات الطبية المرتبطة بتجلط الدم حيث يعمل كمضاد للتخثر لمنع تكون او زيادة حجم الجلطات، يوصى به عادة في حالات الوقاية من تجلط الدم العميق خاصة عند المرضى الذين طرِحوا للفراش لفترات طويلة او خضعوا لجراحة، علاج الجلطات الدموية في الاوردة او الرئتين، الحفاظ على سيولة الدم خلال الاجراءات الطبية مثل غسيل الكلى او استخدام القسطرة الوريدية، منع تكون الجلطات في بعض الاجهزة الطبية مثل مضخات القلب الاصطناعية، يتطلب استخدام دواء
هيبارين اشرافا طبيا دقيقا لتجنب اي مضاعفات او اثار جانبية محتملة قد تنجم عن الافراط في تخفيف الدم.