حقن اسمافرون تستخدم لعلاج مجموعة متنوعة من الأمراض الفيروسية، ومنها التهاب الكبد الفيروسي بنوعيه B وC، وفيروس الهربس البسيط، والهربس النطاقي (الحزام الناري)، اضافة الى فيروس نقص المناعة المكتسبة (الإيدز) بهدف تخفيف الأعراض، كما تساهم في علاج الحصبة، الإنفلونزا، والثآليل التناسلية، أما بالنسبة للأمراض الناتجة عن اضطرابات في جهاز المناعة، فإن
اسمافرون يعالج متلازمة شوغرن، التهاب المفاصل الروماتيزمي، مرض بهجت، الذئبة الحمراء الجهازية، التهاب عضلة القلب، الألم العضلي الليفي، التصلب المتعدد في الجهاز العصبي، وكذلك حمى البحر الأبيض المتوسط العائلية.